Переход через Гиндукуш произошел весной 329 >г. и продолжался 12 дней. Македоняне очутились теперь в Бактрии (на севере Афганистана).
Бесс в это время находился в городе Аорые (теперь Ташкурган). Вместе с ним были Оксиарт, Спитамен и еще несколько других представителей персидской знати. Вооруженные силы Бесса состояли из 7000 бактрийских всадников и степного племени дагов. Чтобы затруднить Александру доступ в Бактрию, Бесс приказал опустошит!) всю область к северу от Гиндукуша. Однако это не остановило македонян. Терпя жестокие лишения от холода и недостатка съестных припасов, они заняли город Драпсак (теперь Кундуз), заходя в тыл Бессу. Это заставило его покинуть Аорн и: переправиться на ту сторону реки Окса (Аму-Дарьи), в Согдиану (теперь Узбекская ССР). Но бактрийские всадники не последовали за ним и постепенно разъехались по домам. Македоняне заняли Аорн и столицу Бактрии — Бактры (теперь город Балх).
Из Бактр Александр направился к Оксу и перешел реку в том месте, 'где теперь проходит государственная граница мевкду СССР и Афганистаном, на самом стык© Узбекской и Туркменской ССР. Так как Бесс сжег все транспортные средства, то македонянам пришлось переправляться на бурдюках, т. е. кожаных мешках, набитых мякиной, соломой и т. п. Переправа войска потребовали пяти дней.
Вскоре после этого к Александру явились посланные от Сшитамена и других персов, находившихся с Бессом. Те сообщили, что они 'готовы выдать Бесса, если Александр пошлет к .ним отряд войска под начальством доверенного лица. Бесс, заявили они, теперь находится у них под арестом. Александр приказал несколько замедлить движение вперед всего1 войска, а к Спитамеву послал Птолемея с сильным отрядом. Через четыре дня Птолемей подошел к лагерю, в котором только накануне были персы. Оказалось, что Сяитамен отказался от своего первоначального намерения лично выдать Бесса. Птолемей, оставив свою пехоту, бросился вперед с всадниками и скоро приблизился к небольшому местечку, где находился с несколькими воинами Бесс, покинутый Спитаменом. Местечко было окружено македонянами, и жители выдали Бесса.
Голый, закованный в железный ошейник, убийца Дария был поставлен возле дороги, по которой шло македонское войско. Александр подъехал к нему и гневно спросил, почему он убил своего царя, родственника и благодетеля? Бесс ответил, что он сделал это не один, а вместе с другими, находившимися тогда около Дария. Таким путем они хотели купить себе спасение у Александра. Но последний приказал подвергнуть Бесса бичеванию, а затем отослал его в Бактры, где впоследствии над ним состоялся суд македонского войска. Бесс был приговорен к смерти. У него отрезали нос и уши и затем отправили в Экбатаны. Там по персидскому обычаю его казнили четвертованием. Этим жестом Александр хотел приобрести симпатии персидской знати.
При переходе через Паропамис македонское войско потеряло много лошадей. Поэтому после поимки Бесса Александр прежде всего занялся комплектованием своего конского состава. Потом 'направился в Мараканды (теперь Самарканд), столицу Согдианы. В этой отдаленной области персидского государства Александру суждено было провести два года.